失落的方舟暗影之塔位于贝隆城，是这座主城核心区域的标志性黑色高塔建筑，玩家可直接在贝隆城找到名为高塔的互动建筑，选择进入暗影之塔开启挑战。
贝隆城作为游戏中的核心主城，暗影之塔的位置极为显眼，矗立在主城中心地带，通体由深色石材构筑，塔身高耸入云，与周边建筑形成鲜明对比。进入暗影之塔的方式十分直接，靠近高塔后触发互动界面，即可选择挑战模式。该玩法为单人专属挑战，全程无法组队，每一层的挑战都需要独立完成，且每层挑战失败后可无限次重试，直到成功通关。挑战暗影之塔有明确的装等门槛，初始进入需装等达到302，挑战20层时建议装等420，想要通关顶层50层，则需要装等提升至540以上，装等未达标时，角色的输出与生存能力会大幅受限，很难突破高层难度。
暗影之塔总计50层，每层的挑战机制各不相同，涵盖清怪、BOSS战、机关破解、生存规避等多种类型。低层以基础清怪与简单BOSS为主，熟悉技能循环即可轻松通过，到了中层开始出现特殊机制，例如24层需要击败特定怪物收集影子印记，完成收集后才能解锁通往上一层的通道。高层难度骤增，48层是极具代表性的难点关卡，进入该层后角色会被施加持续沉默效果，所有技能与常规攻击都无法使用，只能依靠提前准备的道具通关。应对此层可携带万能药水，使用后短暂解除沉默，抓住窗口期释放爆发技能输出；也可准备燃烧瓶、火焰地雷等投掷道具，通过拉扯走位，持续用道具伤害磨死精英怪。20层与50层的BOSS战同样关键，20层BOSS半血以下会遮蔽地面技能警示，需观察BOSS手部动作判断安全区域，50层BOSS则拥有高额伤害与多段范围技能，需合理规划爆发与减伤技能的释放时机。
挑战暗影之塔的核心奖励集中在首次通关，账号内首个角色通关20层与50层时，可分别获得技能点药水，这是提升角色技能点数的关键道具，对角色强度提升至关重要。除此之外，还能获取卡牌包、杰作、巨人之心、刻印选择箱等稀有奖励，助力角色全方位成长。账号内后续角色再挑战暗影之塔，奖励会替换为和谐碎片、飞跃石、守护石碎片等强化材料，虽无技能点药水，但仍是小号快速提升装备的重要途径。挑战前需做好充分准备，背包常备生命药水、护盾药水、万能药水等消耗品，同时搭配适合爬塔的技能加点，优先选择爆发高、续航强、范围广的技能组合，面对不同机制楼层时灵活调整打法，才能稳步突破每一层的阻碍。
