选择合适的飞船是高效完成任务的关键。不同阵营的飞船在属性、武器系统和战术定位上存在显著差异，需根据任务类型和玩家操作习惯进行选择。新欧罗巴联邦的舰船以高护甲和导弹武器为主，适合需要持久作战的任务；晨曦经合体的舰船机动性强，搭载粒子炮，适合快速打击和灵活应对突发情况；天启帝国的舰船装饰华丽，激光炮射程远，适合远程火力支援；斯瓦罗斯共和国的舰船结构坚固，磁轨炮爆发力强，适合高难度战斗任务。
护卫舰和驱逐舰是新手玩家执行常规任务的首选。护卫舰体型小、成本低，机动性出色，适合执行阻截、干扰和侦察类任务，尤其在需要快速脱离战斗的场景中表现优异。驱逐舰则兼顾火力与灵活性，山猫级驱逐舰是T1驾照考试中的推荐选择，其均衡的性能和护盾恢复能力能有效应对制动型、狙击型和重装型敌人的混合编队。若任务对射程有较高要求，可优先选择搭载导弹或磁轨炮的舰船，利用射程优势减少战损。
巡洋舰和战列舰适合中后期高收益任务，但需注意操作复杂度与资源消耗。巡洋舰在火力、防御和机动性之间取得平衡，尤其适合需要长时间作战的探索类任务，例如虫洞探索或深空探秘。战列舰则侧重火力压制与生存能力，在主权争夺或大型PVE任务中表现突出，但跃迁启动较慢，需避免在敌对区域单独行动。配置时应优先考虑护盾恢复装置和抗性增益模块，确保在高强度战斗中维持续航。
舰船配装需结合科研等级与驾照加成。武器选择需与舰船特性匹配，例如新欧罗巴舰船优先搭载导弹以发挥伤害加成，而晨曦舰船更适合粒子炮。组件槽位有限时，应优先提升火力或护盾恢复效率，同时确保计算力与功率满足装备需求。T2及以上舰船需通过破译系统、开发或声望商店获取蓝图，其性能提升显著，但需投入更多资源培养。
在安全星系执行采矿或贸易任务时，可选用货舱扩容的工业舰；而在高威胁区域，需配备隐身装置或跃迁阻断干扰器的战斗舰船。试验场等声望任务对战斗要求较低，但建议选择射程远的护卫舰以应对突发状况。若任务目标包含空间站攻防，需采用环绕战术并优先击毁敌方狙击单位。
合理利用植入体系统可进一步优化舰船性能。植入体分为顶叶、颞叶、额叶和枕叶四个区域，提供属性加成或技能强化。原厂植入体虽加成条目随机，但可作为开发材料；定制化植入体方案能针对特定任务提升命中率、射程或护盾抗性。建议为每类任务配置独立的植入体方案，并通过快捷切换适应多变战场。
