晓觉醒的BOSS普遍具备秒替身、高爆发、强走位的特点，因此控制替身时间差成为制胜关键。推荐使用螃蟹霸体的经典组合：开局优先释放螃蟹通灵（如老紫的熔遁螃蟹）触发BOSS替身，随后立即开启霸体技能贴身强攻。这种打法既能规避BOSS替身后的反打，又能通过霸体保护确保输出稳定性。例如使用佩恩天道时，螃蟹命中后接万象天引可形成长时间连击，若BOSS再次替身，则需快速后撤等待下一轮技能循环。
不同BOSS存在显著特性差异，需针对性选择角色。例如对抗阿飞时，推荐宇智波鼬或青年三船，前者凭借天照的远程摸奖能力可有效规避神威的无敌帧，后者则通过突进技能压制走位空间。技能配置上，冰冻密卷对除阿飞外的多数BOSS有奇效，而面对角都这类高爆发角色时，解术复等反制型密卷能显著提升生存率。部分忍者如百战不灭大蛇丸的复活机制，可在失误时提供二次输出机会。
觉醒阶段的BOSS会激活特殊形态，如迪达拉的黏土自爆和带土的时空间穿梭。需观察前摇动作：迪达拉抬手时迅速横向位移可躲避范围轰炸，带土虚化期间则要保留替身用于规避后续抓取。资源管理方面，奥义建议在BOSS血量低于50%时使用，部分忍者（如死门凯）的奥义具备斩杀效果，可跳过危险阶段。
