游戏里面的剧情副本正常忍者都能打过，但是还有团本和秘境这两个高难度的副本。团本和秘境不仅对战力有要求，还有忍者要求正常的忍者根本打不过。我们获得的大部分忍者都是为了打pvp的，只有机制厉害打副本简直就是刮痧，只有几个忍者可以在副本中大放光彩。秘境对忍者的要求，相对于没有团本那么高，能打出高额的伤害就好。团本就不一样了，这个副本不像秘境一样能一个人直接打，团本是多人合作过关，对忍者还有团队的默契都有很大的考验。
打秘境的话用宇智波鼬还有佩恩就可以，这两个都是伤害比较高的忍者。鼬主要是依靠拿个天照，能够一直给敌人造成持续伤害。鼬的技能冷却很快，可以快速积攒奥义点释放大招。佩恩的所有技能伤害都很高，特别是大招还能造成两段高额伤害，对于秘境这种不需要搭配只需要伤害的副本非常好用。还有虎皮刷秘境也很好用，他能抓取到敌人能够在喷火造成高额伤害，同时还有一小段虚化能够躲掉一部分伤害。如果这些忍者都没有的话，也可以用鬼鲛，他虽然伤害没有其他忍者高但是他的技能范围大，最重要的是这个忍者是直接白送的。
相对于秘境团本对忍者的要求就高很多，如果我们战力不够打怪只能刮痧就用小奇拉比。这个忍者可以给附近的友军增加攻击力，是游戏里面唯一可以给队伍中加战力的忍者，不管是130级还是150级的团本里面都可以用。在所有游戏里面辅助性角色都是很吃香的，有小奇拉比根本不用怕自己战力不够而被踢。130级的团本里面最好用的就是秽土三代，他是游戏里面伤害最高的忍者。用三代打130级的团本只需要猛猛灌伤就好，这个团本是没有什么附加要求的只需要把boss打死就算胜利，所以只需要将伤害打到最满就好。
150级的团本对于130级团本来说就需要配合了，这个团本不仅需要一定时间通过还要死亡次数要求。如果战力高不怕被boss技能秒可以继续用三代来打，不管什么副本秽土三代都是最快的。战力不够还选三代的话很容易被boss的技能给打死，这个忍者是没有任何保护手段的，这个团本最多只能复活10次用完就没了。战力不是很高可以用须佐鼬，这个忍者可以造成持续的伤害，还有须佐可以免伤保护安全，是最适合150级副本的忍者。
