舰船系统的核心在于设计图获取、材料收集与建造流程的合理规划。设计图作为开启新舰船的基础，需通过任务、活动或市场交易获取，完整的设计图能显著提升舰船性能。材料收集则需要平衡通用基础材料与特定高级材料的获取效率，前者依赖采矿和战斗，后者需针对性地参与特定活动或地图探索。
前期优先发展工程船保障资源采集效率，战斗舰船选择应参考蓝图研究概率，护卫舰和驱逐舰是初期主力，而航母等高级舰船需谨慎投入资源。舰船强化需通过战斗或任务获取技术值，重点提升前排护甲与后排输出能力。不同舰船类型存在明确的克制关系，例如战机针对护卫艇、护艇舰针对战机，需根据敌方阵容灵活调整编组策略。
侦察型舰船应优先动力系统，运输舰侧重仓储与动力，战斗型舰船则按策略技能＞冷却＞暴击＞命中的优先级分配。特殊舰种如奶船需强化治疗效率，ST59这类前排舰船则应侧重能量抗性与护甲。加点方案会直接影响实战表现，例如刺水母、红宝石等版本强势护航艇需严格遵循输出向加点逻辑才能发挥最大效能。
资源管理是舰船发展的基础支撑，金属、晶体、重氢的采集需合理分配工程船数量，每个资源点仅允许单艘工程船作业。通过升级工程船蓝图中的采集技能可提升效率，注意资源点的储量上限。基地建设方面，通用港口、主力舰生产线等关键建筑的升级顺序直接影响舰船解锁进度。利用计划圈机制和增援功能可优化舰队调度效率，例如高速侦查舰先行探路再增援主力舰队的操作能大幅节省航行时间。直射武器优先攻击前排目标，曲射武器则按战斗序列选择目标。防空值的计算涉及武器个体数、输出周期、命中效率等多重因素，无人机等特殊单位具有独立作战逻辑。当舰船血量低于10%时会触发阵位后移机制，所有武器需重新锁定目标，部分舰船还拥有概率性的紧急规避特性。
